(クレセット)
Cresset
化合物デザイン支援ソリューション
製品概要
Cresset (クレセット) は、計算化学者や創薬化学者による化合物デザインを支援する計算化学ソフトウェアを提供します。 Cresset 製品は、世界の製薬企業トップ 10 のうち 8 社に採用されており、製薬業界以外にも、香料や農薬、ファインケミカルなど、 様々な化学分野の研究開発にご利用いただけます。
特長
分子の相互作用を精度良く再現する独自の XED 力場をはじめとした、豊富な計算科学的アプローチを直感的な操作で利用でき、結果を視覚的に分かりやすい形で提供します。
分子の静電的な性質を考慮した XED 力場を使用
リガンドとタンパク質が結合する際にはたらく相互作用において、分子の静電的特性は重要な要素です。 Cresset 製品では、原子中心から離れた電荷(右図:紫色の小さいボール)をモデル化した XED 力場を用いることで、リガンドやタンパク質の詳細な静電的特性を表現しています。 XED 力場により、分子間相互作用を高精度に再現したシミュレーションや、リガンドの部分構造を置換した際に静電的特性がどのように変化するかを確認することが可能です。
視覚的に理解しやすい 3D 表示
Cresset 製品は、計算結果を視覚的に理解しやすい形で表示します。 右図は、タンパク質の 3D 表面に色を付けることで、タンパク質に結合しているリガンドとタンパク質との静電的な相性を可視化しています。 緑色は静電的に高い相補性を示す領域、赤色は静電的に低い相補性を示す領域を表しており、複数の候補化合物を比較する際や、次の化合物デザインの指針を立てる際に役立ちます。
迅速・簡単な分子操作や計算のセットアップ
2 つの分子をリンカーで連結させて 1 つの分子を作る、分子内の2つの原子をリンカーで連結させてマクロ環化させる等の複雑な分子操作や、 ドッキングシミュレーションや分子動力学シミュレーション等の計算に必要な一連の処理を、ウィザード形式によるセットアップで迅速かつ簡単に実行することができます。 (右図:分子動力学シミュレーションの設定画面)
研究者のこのような悩みを解決
課題 1 | MD計算、ドッキング、結果の可視化等を別々のソフトウェアで行っており、煩雑である。 |
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解決 1 | 各種計算の実行、結果の可視化・解析等の機能が Flare1つに揃っています。 |
課題 2 | 標的タンパク質の構造情報がない場合のアプローチに悩んでいる。 |
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解決 2 | Flare では、標的の構造が無い場合も、活性リガンドの結合に関する知見を提供します。 |
課題 3 | 分子操作や計算の準備(例:結合自由エネルギー計算)が難しい。 |
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解決 3 | セットアップされたワークフローで手軽に実行可能です。 |
カタログ
価格・動作環境
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