Interstage List Creatorの同一帳票において、バーコードの表示／非表示を切替えることはできますか？

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同一帳票において、バーコードの表示／非表示を切替えることはできますか？

できます。
バーコード項目に対して半角空白だけのデータを指定することで非表示にすることができます。