Interstage List Creatorにおいて、バーコードの文字印刷部分のフォント指定をすることはできますか？

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バーコードの文字印刷部分のフォント指定をすることはできますか？

できません。
バーコードの文字印刷部分のフォントは、Interstage List Creator側でイメージとして生成されますので、このフォントを変更することはできません。バーコードの文字印刷部分のフォントを変更する場合、バーコード項目ではバーだけを出力し（バーコード項目のプロパティで「文字印刷」をOFFにし）、その下にテキスト項目を別途定義し、そのテキスト項目についてフォント指定した上で出力することで、任意のフォントで出力することができます。