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日本遗传学研究所与富士通共同开发世界最高速的新一代生物数据库

突破常理,实现目前检索速度的1000倍,并大幅度降低运营成本(TCO)力争成为世界标准

富士通株式会社

东京, 2004-07-16

国立遗传学研究所(静冈县三岛市、所长代理:小原雄治、以下简称为遗传研)与富士通株式会社(东京都港区、代表取缔役社长:黑川博昭,以下简称为富士通)在共同迎接遗传基因时代的到来之际,在日益重要的生物领域中(2010年的市场规模将达到25兆日元),围绕作为科研及业务的基础的数据库技术,就共同研制开发世界最高速的新一代数据库系统,并力争使其成为该领域的世界标准达成合意。

此次共同开发的系统是以富士通研制的XML型数据库引擎「Interstage Shunsaku Data Manager Enterprise Edition(以下简称Interstage Shunsaku,(级际杰作)」作为核心技术。在发表此信息之前所开发的原型系统中,其技术指标已达到目前系统的100倍的高速搜索速度。

此外,该原型系统计划由遗传研所属的生命信息·DDBJ研究中心(中心主任:五條堀孝、以下简称DDBJ)在本年内向全世界公开发布。

遗传研所属的生命信息·DDBJ研究中心与欧洲分子生物学研究所(EMBL)、美国国立卫生研究所(NIH)作为国际三大DNA数据银行,共同运营日本DNA数据银行(DDBJ: DNA Data Bank of Japan),并建立和提供世界最大的基因与遗传信息数据。DDBJ积累了日本国内的各类生物基因工程的数据及专利厅公开的数据,被定位于日本的国际性生命科学的研究基地。

目前,已登记在册的DNA数据已达到3,500万件, 398亿种(约合200年的报纸发行量),而且,DNA数据的登记量也呈现出爆发性的增长(年增长倍率为2倍)。此外,数据使用者1天的访问量已达到1万件以上。因此, DNA数据库的高速化已形成白热化的竞争局面,成为围绕基因研发的国际竞争中的关键技术。

在此次共同研发项目中,富士通将领先全球的「Interstage Shunsaku」这一全新的XML型数据库引擎作为先进的核心技术而加以应用。这种世界最新的技术可实现对大规模数据量以及大量检索要求进行世界最高速的检索,针对数据使用者的各种需求达到瞬间反馈结果的功能。因此,如果此次的共同研发能够取得成功,不仅可以推进目前以个体-器官-组织-细胞-分子而划分等级展开的独立研究的顺利实施,更可以站在医疗的最前线,作为治疗癌症、高血压、糖尿病等疾患的关键技术,基于最新的研究成果,实现毛细血管的医疗,更可以划时代地缩短新药的开发周期。也就是说,该技术的应用可以加速推进健康医疗社会的形成。此外,通过这种超高速的数据库检索技术,可在世界范围内吸引众多的使用者,在实质上形成基因信息的国际标准。

富士通与DDBJ从搜索一般文件的Interstage Shunsaku的超高速处理技术出发,以高速成长且急需先进的信息技术的基因领域作为规模大,复杂性高的数据处理技术的最佳实践和试验场地,通过共同开发和研究,力图研制出新一代的生物数据库系统。基于在该领域的业绩,富士通会将新技术推广至其他更为广泛的业务领域乃至全球,而DDBJ也誓将在生物信息学领域中确立并巩固其世界的领导地位。


★ 相关链接

富士通研制的XML型数据库引擎SInterstage Shunsaku概要介绍
0716_1

国立遗传学研究所
0716_2


文中记载的产品名称和固有名词是各企业/机构的商标和登录商标。

新闻ID: 2004-07-16
日期: 2004-07-16
城市: 东京
公司: 富士通株式会社