計算化学統合プラットフォーム SCIGRESS(サイグレス)

研究者に選ばれ続ける
富士通が生んだ
分子シミュレーションソフト

分子力学法、分子動力学法、半経験的分子軌道法、非経験的分子軌道法、密度汎関数法、第一原理計算を、直感的な操作でご利用いただけます。
専門家による受託計算も行っており、お客様の新材料、新素材の研究開発を支援します。

分子シミュレーションを計算科学の専門知識がなくとも
実現できることをご存じでしたか?

研究者のこのような悩みを解決

課題 1分子シミュレーションを行うための操作方法の習得や、計算の設定が難しそう
解決 1複雑な操作が不要の簡単なUIで、誰でも手軽に計算機能をご利用いただけます
課題 2実験データだけでなく、理論的な裏付けとなる計算データも研究に活かしたい
解決 2様々な理論に基づいた計算を容易に実行でき、仮説構築、論文作成への活用が可能です
課題 3新規の材料探索に手間・時間をかけずに、効率的なアプローチを試みたい
解決 3実験を行う前に計算機上で結果の予測ができ、効率化と精度向上を実現できます
課題 4分子シミュレーションを使ってみたいが、ソフトの操作を覚えるのは面倒だ
解決 4お客様がされたいことを、富士通の専門家が受託して計算することも可能です

SCIGRESSの特長

これから分子シミュレーションを取り組もうとされている、あらゆる研究者にご利用いただけます。
特に実験研究者の方に高い評価をいただいています。

選ばれ続ける理由

導入実績(公開ユーザー)

  • 九州大学
  • 京都大学
  • 日本大学
  • 千歳科学技術大学
  • 法政大学
  • 山形大学
  • 鹿児島大学

※SCIGRESSの関連製品を含んでいます。

お客様の声

幅広い適応分野

製品概要

簡単で直感的なGUI

Workspaceは分子を構築するためのモジュールです。マウスだけで簡単に構築可能です。
更に計算結果により、分子軌道や静電ポテンシャル図、UV-Visスペクトル、IRスペクトルを表示します。

3分でわかる!SCIGRESSダイジェスト

対応分子系

低分子、高分子、結晶、アモルファス、溶液、界面など

対応計算法

分子力学法、非経験的分子軌道法、半経験的分子軌道法、密度汎関数法、分子動力学法、第一原理計算

  • MD-ME

    富士通独自開発の本格的な分子動力学プログラムです。
    溶液・固体など、さまざまな系のダイナミクスを計算でき、拡散係数や速度自己相関関数などの様々な二次解析機能に対応しています。

  • MO-G&MO-S

    MOPAC2002を基に富士通が独自に改良を加えた半経験的分子軌道法計算プログラムです。
    双極子モーメント、部分電荷、結合次数、ポテンシャルエネルギー局面、構造最適化、励起状態、開殻系を取り扱えます。

  • Mechanics

    分子力学法を用いて分子の最適構造などを計算するプログラムです。

  • Dynamics

    分子動力学法のプログラムで、分子モデルの挙動をシミュレーションできます。

  • Extended Huckel

    シュレディンガー方程式を解く経験的な分子軌道法プログラムです。

  • ZINDO

    半経験的分子軌道法のプログラムです。

  • 外部プログラムインターフェース

    「LAMMPS」「Quantum ESPRESSO」「GAMESS」「Gaussian」「MOPAC2016」「CONFLEX7」などの富士通製以外の外部プログラムとも、SCIGRESS上で共通のGUIを介した円滑な連携が可能です。

LAMMPSのニッケル結晶の応力誘起相転移の計算

主な機能

製品仕様

製品構成

基本パッケージ

  • SCIGRESS Basic
    SCIGRESSの基本パッケージ GUI機能および基本計算エンジンを収録

    Mechanics:分子力学法プログラム
    Extended Hückel:分子軌道法プログラム
    ZINDO:紫外可視スペクトル計算プログラム
    DGauss:密度汎関数法プログラム
    Gaussian連携機能:Gaussian社製Gaussianの連携機能(Gaussianは別途購入が必要)
    GAMESS連携機能:アイオワ州立大学で開発されたGAMESSの連携機能(GAMESSは別途入手が必要)

オプション

ライセンス形態

ライセンス管理

  • スタンドアロン
    利用する端末ごとにライセンスを発行します。
    SCIGRESSをインストールする端末数と 同数のライセンスをご購入いただく必要があります。
  • フローティング
    ライセンスサーバに対してライセンスを発行します。
    SCIGRESSをインストールする端末数は無制限ですが、 同時使用ができる端末の数はライセンスの購入数が上限です。
    このライセンス方式ではLinux計算サーバを使用できます。

動作環境

Windows版OS:Windows 10, Windows 11
CPU:Core i5 8000番以上推奨
メモリ:8GB以上推奨
Linux版(計算エンジン専用)OS:RedHat Enterprise Linux 7,8 , CentOS 7, Ubuntu
CPU:Core i5 8000番以上推奨
メモリ:8GB以上推奨

価格

価格につきましては、下記「お問い合わせ」よりお問い合わせください。
別途、教育機関向け価格もご用意しております。
導入・サポート費用につきましては、別途お見積りとなります。

導入までの流れ

ご導入前にご自身でSCIGRESSを検証されたいケース

  • ※1
    お申込みいただいた後、無料体験版のダウンロードサイト、チュートリアル資料、トライアルライセンスをメールにてご案内いたします。

ご導入前にお客様がご自身でSCIGRESSを検証するのが難しいケース

  • ※2
    無償で実施する場合は、計算事例としてホームページに公開することがありますのでご了承ください。

よくある質問

ライセンスについて

    • A1:特定のPCのみで利用するスタンドアロンライセンスと、インストール数は無制限で同時起動数を管理するフローティングライセンスがあります。
      両方とも価格は同じで、ライセンスを発行する時にご希望のライセンスを発行します。
    • A2:はい、可能です。
    • A3:はい、問題ありません。フローティングライセンスの場合は同時に起動できる数は一つ(ご購入いただいたライセンス数)となります。
    • A4:計算エンジン(MO-G、MD-ME)は1ライセンスで8コア(8並列)までご利用いただけます。(V2までは2コア(2並列)まで)
      ただし、オープンソフト(OSS)を使った計算については制限なくご利用いただけます。
    • A5:ライセンスサーバにアクセス出来れば、お客様の各事業所にてご利用いただくことができます。
    • A6:永久ライセンス、年間ライセンスをご用意しております。ご希望に応じて月間ライセンスも提供しておりますので、年度末までの期間ライセンスをご希望の際はご相談ください。
      また、アカデミアのお客様には講義でご利用いただくことができる期間ライセンスもございます。
    • A7:SCIGRESSが起動しなくなります。
    • A8:はい、可能です。ただし、旧バージョンだと新しいパソコンの最新OSに対応していないことがあるので、ご注意ください。
    • A9:大変申し訳ありませんが、販売・サポートを終了しておりますので、ライセンスの発行はできません。
    • A10:SCIGRESSをインストールした後に表示されるHardwareIDをサポート宛にご連絡ください。

プログラムサポート(保守)

    • A11:質疑応答サポート、レベルアップ版、バージョンアップ版のご提供となります。
    • A12:年間ライセンスは期間中のサポートを含んでおりますが、永久ライセンスは初年度から有償となりますので、ライセンスと合わせてご購入をお願いいたします。
    • A13:任意とはなりますが、ご契約いただいたお客様には操作に関するQ&AをメールやWeb会議にて対応させていただきます。
      初めてご利用いただくお客様には、操作においてご不明な点も多いかと存じますので、初年度はプログラムサポートへのご加入をお願いしております。
    • A14:はい、ライセンス購入時に遡ってご締結いただくことができます。
    • A15:制限はありません。契約期間中は何回でもご質問をお受けしております。
    • A16:はい、有償で個別説明会をお受けしています。オンサイトかWeb会議のどちらの形式で開催するかはご相談させてください。

設定、機能、その他

    • A17:クライアントマシンがいつ起動するかわからない場合は、常時起動させておくことをお勧めいたします。
    • A18:スタンドアロンライセンスでのみ使用可能です。
    • A19:含まれていません。GAMESS、LAMMPS、Quantum ESPRESSOなどのオープンソフトは利用者ご自身でダウンロード・インストールいただく必要があります。
    • A21:サイグレスです。

論文リスト

  • KE LIU, YIHUA HAN, ZHANGFU YUAN, LIGUANG ZHU, and XIANGTAO YU
    Effect of MgO on the Viscosity and Structure of CaOAl2O3-B2O3-Based Non-reactive Mold Flux
    Metallurgical and Materials Transactions B volume 53, pages1504–1515 (2022)
  • P. Chandra Sekar, D. Meshach Paul, E. Srinivasan & R. Rajasekaran
    Unravelling the molecular effect of ocellatin-1, F1, K1 and S1, the frog-skin antimicrobial peptides to enhance its therapeutics—quantum and molecular mechanical approaches
    Journal of Molecular Modeling volume 27, Article number: 10 (2021)
  • Matthias Jochem,Daniel Limbach,Stefan Glang,Tobias Haspel,Heiner Detert
    Experimental and theoretical investigation on the thermal isomerization reaction of tristriazolotriazines
    J Phys Org Chem.2022;e4346.
  • Akira Takeuchi
    Adsorption of Cs+ Ion into Di- and Tri-Octahedral Vermiculites as Demonstrated by Classical Molecular Dynamics Simulation
    Materials Transactions, Vol. 62, No. 4 (2021) pp. 469 to 478
  • Andrzej Danel, Anna Kolbus, Danuta Grabka, Mateusz Kucharek, Monika Pokładko-Kowar
    1H-Pyrazolo[3,4-b]quinoline derivative with the chelating substituent: Synthesis and spectral properties as a fluorescent sensor for cation detection
    Dyes and Pigments 195 (2021) 109713
  • Maciej Krzywiecki, Sandra Pluczyk-Małek, Paulina Powroznik, Czeslaw Slusarczyk, Wirginia Król-Molenda, Szymon Smykała, Justyna Kurek, Paulina Kopton, Mieczysław Łapkowski, and Agata Blacha-Grzechnik
    Chemical and Electronic Structure Characterization of Electrochemically Deposited Nickel Tetraamino-phthalocyanine: A Step toward More Efficient Deposition Techniques for Organic Electronics Application
    J. Phys. Chem. C 2021, 125, 13542−13550
  • Ahmed Abdel-Karima, Sameh H. Ismail, Ahmed M. Bayoumy, Medhat Ibrahim, Gehad G. Mohamed
    Antifouling PES/Cu@Fe3O4 mixed matrix membranes: Quantitative structure–activity relationship (QSAR) modeling and wastewater treatment potentiality
    Chemical Engineering Journal, Volume 407, 1 March 2021, 126501
  • Hikari Watanabe, Nana Arai, Erika Nozaki, Jihae Han, Kenta Fujii, Kazutaka Ikeda, Toshiya Otomo, Kazuhide Ueno, Kaoru Dokko, Masayoshi Watanabe, Yasuo Kameda, and Yasuhiro Umebayashi
    Local Structure of Li+ in Superconcentrated Aqueous LiTFSA Solutions
    J. Phys. Chem. B 2021, 125, 7477−7484
  • Łukasz Kaczmarek, Magdalena Balik, TomaszWarga, Ilona Acznik, Katarzyna Lota, Sebastian Miszczak, Anna Sobczyk-Guzenda, Karol Kyzioł , Piotr Zawadzki and AgnieszkaWosiak
    Functionalization Mechanism of Reduced Graphene Oxide Flakes with BF3 THF and Its Influence on Interaction with Li+ Ions in Lithium-Ion Batteries
    Materials 2021, 14, 679
  • Urszula Kosikowska, Monika Wujec, Nazar Trotsko, Wojciech Płonka, Piotr Paneth and Agata Paneth
    Antibacterial Activity of Fluorobenzoylthiosemicarbazides and Their Cyclic Analogues with 1,2,4-Triazole Scaffold
    Molecules 2021, 26, 170
  • 片岡 洋右
    分子動力学シミュレーションによるアルゴンのポテンシャルエネルギーと圧力の揺らぎ
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.36 2021 年
  • 片岡 洋右
    分子動力学法によるアルゴンの3重点
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.36 2021 年
  • 片岡 洋右
    定圧分子動力学法によるアルゴンの沸点における気液平衡
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.36 2021 年
  • 橋信明, 中村祐太, 神林なつみ, 中村柊介, 佐藤大地, 山田一雅
    新教材・教育法の開発を目指した3D プリンタによる分子計算のマテリアリゼーション(4)
    八戸工業高等専門学校紀要 第55号(2021, 02)
  • Amina Omar, Hend Ezzat, Hanan Elhaes, Medhat A. Ibrahim
    Molecular Modeling Analyses for Modified Biopolymers
    Biointerface Research in Applied Chemistry, Volume 11, Issue 1, 2021, 7847 - 7859
  • Amal H. Al-Bagawi, Eid E. Salama
    Computational Study on the Electronic Properties of Graphene/Calcium Oxide Nanocomposite
    Egypt. J. Chem. Vol. 64, No. 1 pp. 407 - 412 (2021)
  • Thomas Rybolt and Heir Jordan
    Interactions and Binding Energies in Carbon Nanotube Bundles
    Appl. Nano 2021, 2, 128–147.
  • Yoshio Iwai and Kai Nishiyama
    Molecular Dynamics Simulation of the Diffusion Coefficients of Anthraquinone in Poly(Methyl Methacrylate) Swollen by Supercritical Carbon Dioxide
    Journal of Chemical Engineering of Japan, Vol. 54, No 8, pp. 417-423, 2021
  • Wakako Araki, Kazuya Suzuki, Yoshio Arai
    Lithium diffusion in La2/3–xLi3xTiO3 (x = 0.115) with 3D-ordered configurations
    Solid State Ionics Volume 368, 1 October 2021, 115706
  • Wen-Bo Wang and Makoto Kambara
    A molecular dynamics simulation of inhomogeneous silicon–germanium nucleation from supersaturated vapor mixtures
    AIP Advances 11, 085119 (2021)
  • Susumu Ikeda
    Molecular dynamics simulations of graphoepitaxy of organic semiconductors, sexithiophene, and pentacene: Molecular-scale mechanisms of organic graphoepitaxy
    Japanese Journal of Applied Physics 57, 03EG04 (2018)
  • Zhanlong Piao, Liguang Zhu, Xingjuan Wang, Zengxun Liu, Bo Wang, Pengcheng Xiao and Zhipeng Yuan
    Effects of BaO on the Viscosity and Structure of a New Fluorine-Free CaO-Al2O3-TiO2-Based Mold Flux for High Titanium Steel
    Metallurgical and Materials Transactions B volume 51, 2119–2130 (2020)
  • Paulina Powroźnik, Lucyna Grządziel, Wiesław Jakubik and Maciej Krzywiecki
    Sarin-simulant detection by phthalocyanine/palladium structures: From modeling to real sensor response
    Sensors and Actuators B: Chemical Volume 273, 10 November 2018, Pages 771-777
  • Zhanlong Piao, Liguang Zhu, Xingjuan Wang, Pengcheng Xiao, Jingyi Zhou, Bo Wang, Shuo Qu and Ke Liu
    Effect of BaO on the viscosity and structure of fluorine-free calcium silicate-based mold flux
    Journal of Non-Crystalline Solids Volume 542, 15 August 2020, 120111
  • Takuya Tanaka, Itsuki Kato and Kento Okoshi
    Effect of Side Chain Lengthon Segregation of Squalane between Smectic Layers Formed by Rod-Like Polysilanes
    Journal of Research Updates in Polymer Science, 2018, 7, 1-6
  • Ronald Scott Holt, Thomas R. Rybolt
    Modeling Enhanced Adsorption of Explosive Molecules on a Hydroxylated Graphene Pore
    Graphene Vol.08 No.01(2019)
  • Takeshi Wada, Jing Jiang, Kunio Yubuta, Hidemi Kato, Akira Takeuchi
    Septenary Zr–Hf–Ti–Al–Co–Ni–Cu high-entropy bulk metallic glasses with centimeter-scale glass-forming ability
    Materialia Volume 7, September 2019, 100372
  • Agata Paneth, Wojciech Płonka and Piotr Paneth
    Assessment of Nonnucleoside Inhibitors Binding to HIV-1 Reverse Transcriptase Using HYDE Scoring
    Pharmaceuticals 2019, 12, 64
  • Susumu Ikeda
    Molecular dynamics simulations of graphoepitaxy of organic semiconductors, sexithiophene, and pentacene: Molecular-scale mechanisms of organic graphoepitaxy
    Japanese Journal of Applied Physics 57, 03EG04 (2018)
  • Zhanlong Piao, Liguang Zhu, Xingjuan Wang, Zengxun Liu, Bo Wang, Pengcheng Xiao and Zhipeng Yuan
    Effects of BaO on the Viscosity and Structure of a New Fluorine-Free CaO-Al2O3-TiO2-Based Mold Flux for High Titanium Steel
    Metallurgical and Materials Transactions B volume 51, 2119–2130 (2020)
  • Paulina Powroźnik, Lucyna Grządziel, Wiesław Jakubik and Maciej Krzywiecki
    Sarin-simulant detection by phthalocyanine/palladium structures: From modeling to real sensor response
    Sensors and Actuators B: Chemical Volume 273, 10 November 2018, Pages 771-777
  • Zhanlong Piao, Liguang Zhu, Xingjuan Wang, Pengcheng Xiao, Jingyi Zhou, Bo Wang, Shuo Qu and Ke Liu
    Effect of BaO on the viscosity and structure of fluorine-free calcium silicate-based mold flux
    Journal of Non-Crystalline Solids Volume 542, 15 August 2020, 120111
  • Takuya Tanaka, Itsuki Kato and Kento Okoshi
    Effect of Side Chain Lengthon Segregation of Squalane between Smectic Layers Formed by Rod-Like Polysilanes
    Journal of Research Updates in Polymer Science, 2018, 7, 1-6
  • Ronald Scott Holt, Thomas R. Rybolt
    Modeling Enhanced Adsorption of Explosive Molecules on a Hydroxylated Graphene Pore
    Graphene Vol.08 No.01(2019)
  • Takeshi Wada, Jing Jiang, Kunio Yubuta, Hidemi Kato, Akira Takeuchi
    Septenary Zr–Hf–Ti–Al–Co–Ni–Cu high-entropy bulk metallic glasses with centimeter-scale glass-forming ability
    Materialia Volume 7, September 2019, 100372
  • Agata Paneth, Wojciech Płonka and Piotr Paneth
    Assessment of Nonnucleoside Inhibitors Binding to HIV-1 Reverse Transcriptase Using HYDE Scoring
    Pharmaceuticals 2019, 12, 64
  • 片岡 洋右
    温度一定の分子動力学法によるアルゴンの融解曲線
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.32 2018 年
  • Gordon W. Irvine; Natalie Korkola; Martin J. Stillman
    Isolated domains of recombinant human apo-metallothionein 1A are folded at neutral pH: a denaturant and heat-induced unfolding study using ESI-MS
    Biosci Rep (2018) 38 (4): BSR20180592.
  • Anna Kolbus, Andrzej Danel, Danuta Grabka, Mateusz Kucharek & Karol Szary
    Spectral Properties of Highly Emissive Derivative of Coumarin with N,N-Diethylamino, Nitrile and Tiophenecarbonyl Moieties in Water-Methanol Mixture
    Journal of Fluorescence volume 29, 1393–1399 (2019)
  • Ł.Kaczmarek, T.Warga, P.Zawadzki, M.Makowicz, B.Bucholc, P.Kula
    The influence of the hydrogenation degree on selected properties of graphene as a material for reversible H2 storage
    International Journal of Hydrogen Energy Volume 44, Issue 41, 30 August 2019, Pages 23149-23159
  • 片岡 洋右
    分子動力学による荷電コロイド分散系における添加塩効果
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.31 2017 年
  • Dharmendra K Yadav, Surendra Kumar, Saloni, Harpreet Singh, Mi-hyun Kim, Praveen Sharma, Sanjeev Misra, and Feroz Khan
    Molecular docking, QSAR and ADMET studies of withanolide analogs against breast cancer
    Drug Des Devel Ther. 2017; 11: 1859–1870.
  • Xingjuan Wang, Hebin Jin, Liguang Zhu, Ying Xu, Ran Liu, Zhanlong Piao, Shuo Qu
    Effect of CaF2 on the Viscosity and Microstructure of CaO–SiO2–Al2O3 Based Continuous Casting Mold Flux
    Metals 2019, 9, 871
  • Amal H. Al-Bagawi, Ahmed M. Bayoumy, Medhat A. Ibrahim
    Molecular modeling analyses for graphene functionalized with Fe3O4 and NiO
    Heliyon 6(2020) e04456
  • Hiroaki Kitagishi, Daiki Shimoji , Takehiro Ohta, Ryo Kamiya, Yasuhiro Kudo, Akira Onoda , Takashi Hayashi, Jean Weiss, Jennifer A. Wytko, Koji Kano
    A water-soluble supramolecular complex that mimics the heme/copper hetero-binuclear site of cytochrome c oxidase
    Chem. Sci., 2018, 9, 1989-1995
  • S Matsunaga
    Molecular dynamics study on glycolic acid in the physiological salt solution
    IOP Conf. Series: Materials Science and Engineering 369 (2018) 012014
  • Katarzyna Jedynak, Beata Szczepanik, Nina Rędzia, Piotr Słomkiewicz, Anna Kolbus, Paweł Rogala
    Ordered Mesoporous Carbons for Adsorption of Paracetamol and Non-Steroidal Anti- Inflammatory Drugs: Ibuprofen and Naproxen from Aqueous Solutions
    Water 2019, 11(5), 1099
  • 片岡 洋右
    アルゴンの体積の揺らぎから求めた臨界点
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.35(2020)
  • Shigeki Matsunaga
    Effect of sulfate anion on the structure and transport properties of seawater: A molecular simulation study
    Journal of Molecular Liquids 226 (2017) 90-95
  • Ahmed Refaat, Rasha A.Youness, Mohammed A.Tahab, Medhat Ibrahim
    Effect of zinc oxide on the electronic properties of carbonated hydroxyapatite
    Journal of Molecular Structure Volume 1147, 5 November 2017, Pages 148-154
  • Taka Narumi, Yasushi Shibuta, Takeshi Yoshikawa
    Molecular dynamics simulation of interfacial growth of SiC from Si–C solution on different growth planes
    Journal of Crystal Growth Volume 494, 15 July 2018, Pages 36-43
  • Hend A Ezzat, Maroof A Hegazy, Nadra A Nada, Osama Osman, Medhat AIbrahim
    Application of natural polymers enhanced with ZnO and CuO as humidity sensor
    NRIAG Journal of Astronomy and Geophysics 2020, Vol. 9, No. 1, 586–597
  • Noha A Saleh, Wael M Elshemey
    Structure-based drug design of novel peptidomimetic cellulose derivatives as HCV-NS3 protease inhibitors
    Life Sciences Volume 187, 15 October 2017, Pages 58-63
  • Haruka Kyakuno, Hiroto Ogura, Kazuyuki Matsuda, Yutaka Maniwa
    Ice Nanoribbons Confined in Uniaxially Distorted Carbon Nanotubes
    J. Phys. Chem. C 2018, 122, 18493−18500
  • Norihiko Takahashi, Yu Liu, Chioko Kaneta
    Materials informatics approach for design of Si/Ge layered nanostructures with low thermal conductivity
    Jpn. J. Appl. Phys. 59 051005
  • 片岡 洋右
    分子動力学シミュレーションによる荷電コロイド分散系における秩序構造の安定性-2
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.34(2019)
  • Hend A. Ezzat, Islam Gomaa, Alaa El-Din A. Gawad, Osama Osman, Abdel Aziz Mahmoud, Mohamed S. Abdel-Aal, Hanan Elhaes, Medhat A. Ibrahim
    Semiempirical Molecular Modeling Analyses for Graphene/Nickel Oxide Nanocomposite
    Letters in Applied NanoBioScience, Volume 9, Issue 4, 2020, 1459-1466
  • Yosuke KATAOKA
    Calculation of the Melting Entropy of Argon at Constant Volume Using Molecular Dynamics
    Journal of Computer Chemistry, Japan -International Edition, Vol. 3, 2017-0021 (2017)
  • 片岡 洋右
    分子動力学シミュレーションによるアルゴンの低温構造
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.35(2020)
  • A. Takeuchi, K. Takenaka, Y. Zhang, Y.C. Wang, A. Makino
    Stress-Enhanced Transformations from Hypothetical B2 to Stable L10 and Amorphous to fcc Phases in Fe50Ni50 Binary Alloy by Molecular Dynamic Simulations
    Materials Transactions, Vol. 58, No. 4 (2017) pp. 646 to 654
  • Koji Asama, Tomoki Matsuda, Tomo Ogura, Tomokazu Sano, Makoto Takahashi, Akio Hirose
    Low-temperature metal-to-alumina direct bonding process utilizing redox reaction between silver oxide and organic agent
    Materials Science and Engineering: A, Volume 702, 15 August 2017, Pages 398-405
  • Takanobu Watanabe
    Molecular Dynamics of Dipole Layer Formation at High-k/SiO2 Interface
    ECS Transactions, 80 (1) 313-325 (2017)
  • Ryota Kunugi, Nobuhiro Nakagawa, Takanobu Watanabe
    Driving force of oxygen-ion migration across high-k/SiO2 interface
    Applied Physics Express 10, 031501 (2017)
  • Risa Hirosawa, Yoko Akune, Natsuko Endo, Sayumi Hatano, Takuya Hosokai, Hiroyasu Sato, Shinya Matsumoto
    A variety of solid-state fluorescence properties of pyrazine dyes depending on terminal substituents
    Dyes and Pigments, Volume 146, November 2017, Pages 576-581
  • Thomas R. Rybolt, Claire B. Black
    Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Molecule-Surface Binding Energies in Site Specific Graphene Bilayer Nanopores: A Puzzle-ene Force Field Calculation
    Graphene, 2017, 6, 72-84
  • Connor W.Frye, Thomas R.Rybolt
    Nanohashtag structures based on carbon nanotubes and molecular linkers
    Surface Science, Volume 669, March 2018, Pages 34-44
  • 片岡 洋右
    分子動力学法による液化過程とspinodal線
    法政大学情報メディア教育研究センター研究報告 Vol.34(2019)
  • 大前 貴之
    半経験的分子軌道法によるY字芳香族性の魔法数の研究
    Journal of Computer Aided Chemistry , Vol.20, 18-22 (2019)
  • Jiayang Fei, Ryota Kunugi, Takanobu Watanabe, Koji Kita
    Anomalous flatband voltage shift of AlFxOy/Al2O3 MOS capacitors: A consideration on dipole layer formation at dielectric interfaces with different anions
    Applied Physics Letters 110, 162907 (2017)
  • Akira Akaishi, Tomohiro Yonemaru, Jun Nakamura
    Formation of Water Layers on Graphene Surfaces
    ACS Omega 2017, 2, 2184-2190
  • D. González-Arjona, G. López-Pérez, A. Gustavo González, M. M. Domínguez, W. H. Mulder
    Study of UV Filters as an in silico (QSAR) Graduate Project
    Journal of Laboratory Chemical Education 2017, 5(4): 55-66
  • 金 太成, 林 晏理, 二川 秀史, 白須 圭一, 山本 剛, 橋田 俊之, 細井 厚志, 川田 宏之
    無撚カーボンナノチューブ糸の機械的特性に及ぼす黒鉛化の影響と強度発現機構
    Bulletin of the JSME, Vol.84, No.860, 2018
  • Hara, H. Kazimierczak, A. Bigos, Z. Świątek, P. Ozga
    Effect of Different Organic Additives on Surface Morphology and Microstructure of Zn-Mo Coatings Electrodeposited from Citrate Baths
    Arch. Metall. Mater. (2019) 64 (1), 207-220
  • Angel Zhang, Martin J. Stillman
    Exploring function activated chlorins using MCD spectroscopy and DFT methods: design of a chlorin with a remarkably intense, red Q band
    Phys. Chem. Chem. Phys. (2018) 20, 12470-12482
  • M. Makowicz, M. Balik, Ł. Kaczmarek, T. Warga, M. Stegliński, H. McPhillips, P. Kula
    Spatial functionalization of graphene powder using 1,4-dichlorobutane on ceramic substrate
    Materials Chemistry and Physics (2018) 215, 376-384
  • Ettore Fazio, Cally J. E. Haynes, Gema de la Torre, Jonathan R. Nitschke, Tomás Torres
    A giant M2L3 metallo-organic helicate based on phthalocyanines as a host for electroactive molecules
    Chem. Commun. (2018) 54, 2651-2654
  • Bożena Pietrzyk, Sebastian Miszczak, Łukasz Kaczmarek, Marek Klichxxx
    Low friction nanocomposite aluminum oxide/MoS2 coatings prepared by sol-gel method
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  • Paulina Powroźnik, Lucyna Grządziel, WiesławJ akubik, Maciej Krzywiecki
    Sarin-simulant detection by phthalocyanine/palladium structures: From modeling to real sensor response
    Sensors and Actuators B: Chemical (2018) 273, 771-777
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    Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Molecule-Surface Binding Energies in Site Specific Graphene Bilayer Nanopores: A Puzzle-ene Force Field Calculation
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  • Akira Akaishi, Tomohiro Yonemaru, Jun Nakamura
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    ACS Omega (2017) 2, 2184−2190
  • M. Klein, R. Pankiewicz, M. Zalas, W. Stampor
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  • Rakesh Kumar, Sangeeta Obrai, V K Joshi,Vikas Kumar, Siyamak Shahab
    Computational, crystal structure and antimicrobial studies of directly synthesized dichloroethylenediaminecopper (II) complex
    Commun. Inorg. Synth. (2015) Vol. 3, N°1, 9-15
  • Itoh H, Maeda H, Yamada S, Hori Y, Mino T, Sakamoto M.
    BINOL-Al catalysed asymmetric cyclization and amplification: preparation of optically active menthol analogs
    Org Biomol Chem (2015) 28;13(20):5817-25
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    Force Field Based MM2 Molecule-Surface Binding Energies for Graphite and Graphene
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    Intrazeolite organometallics Pentamethylcyclopentadienyl rhodium complexes.
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    Ab initio derived augmented Tersoff potential for silicon oxynitride compounds and their interfaces with silicon
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  • Slater, Jonathan M. and J. Paynter and E.J. Watt.
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  • Suban K. Sahoo, Rati Kanta Bera, Minati Baral, B.K. Kanungo
    Excited state intramolecular proton transfer (ESIPT) in a dioxotetraamine derived schiff base and its complexation with Fe(III) and Cr(III)
    Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, Volume 188, Issues 2-3, 20 May 2007, Pages 298-310
  • Teresa Łuczak, Radosław Pankiewicz, Bogusława Łęska, Grzegorz Schroeder, Maria Bełtowska-Brzezinska, Bogumil Brzezinski
    Structure and electrochemical behaviour of 4,7-diazaheptyl-trimethoxy-silane and vinyl-trialkoxy-silane adsorbed at silver surface
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    Syntheses, Characterization, and Photophysics Studies of Photoactive Chromophore 2-Naphthyl-Labeled [n]-Ladderanes
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    Formation of Zr66.7Al11.1Ni22.2 noncrystalline alloys demonstrated by molecular dynamics simulations based on distorted plastic crystal model
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    Computer Simuration of an Antiferroelectric Liquid Crystalline Molecule: The Origin of Bent Structure Formation and the Molecular Packing Property of MHPOBC in Crystalline Phase
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    Molecular Dynamics Simulation of an Antiferroelectric Liquid Crystalline Molecule MHPOBC: Conformational Transition in Smectic Phases
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  • K. Matsunaga and H. Matsubara
    Molecular Orbital Calculations on Atomic Structures of Si-Based Covalent Amorphous Ceramics
    Mat. Res. Soc. Symp. Proc. Vol. 538(1999)Materials Research Society
  • K. Matsunaga, S. Ii, C. Iwamoto, T. Yamamoto and Y. Ikuhara
    In situ observation of crack propagation in magnesium oxide ceramics
    Nanotechnology 15(2004)S376-S381
  • K. Matsunaga, Y. Iwamoto, C. A. J. Fisher and H. Matsubara
    Molecular Dynamics Study of Atomic Structures in Amorphous Si-C-N Ceramics
    Journal of the Ceramic Society of Japan, 107[11], 1025-1031(1999)
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    Classical Molecular Dynamics Method As A Tool For Studying Phase Transformations;
    Proceedings of the International Conference on Solid-Solid Phase Transformations ‘99(JIMIC-3) Edited by M, Koiwa, K. Otsuka and T. Miyazaki
    The Japan Institute of Metals, 1999.
  • M.Yoshiya, et al. Pertubed
    Molocular Dynamics for Calculating Thermal Conductivity of Zirconia
    Molecular Simulation Vol30(13-15) P953-961
  • R. Kojima, M. Susa
    Melting of thin γFe-C films having (100), (110) and (111) surfaces in terms of molecular dynamics simulation
    Science and Technology of Advanced Materials, Volume 5, Issues 5-6, September-November 2004, Pages 677-682
  • R. Kojima, M. Susa
    Second moment approximation of tight-binding potential for γFe applicable up to 1700 K
    Science and Technology of Advanced Materials, Volume 5, Issue 4, July 2004, Pages 497-502
  • R. Tarumi, A. Ogura, M. Shimojo, K. Takashima and Y. Higo
    Molecular Dynamics Simulation of Crystallization in an Amorphous Metal during Shear Deformation
    Jpn. J. Appl. Phys. Vol. 39(2000)pp. L611-L613
  • S. Ii, C. Iwamoto, K. Matsunaga, T. Yamamoto, Y. Ikuhara
    TEM in situ observation of fracture behavior in ceramic materials
    Applied Surface Science, Volume 241, Issues 1-2, 28 February 2005, Pages 68-74
  • S. Muto, Y. Masuda and M. Takeuchi
    Molecular Dynamics Study on Local Atomic Displacements Associated with Point Defects and Displacive Phase Transformations
    Materials Transactions, JIM, Vol. 40, No. 6(1999), pp. 514 to 521
  • Satoshi Kojima, Chao Hu
    Plastic deformation by synchronized rotation of nanolayers under high stress in metals
    Materials Science and Engineering: A, 489(1-2), 150-157
  • Shohei Arai, Manabu Togashi, Mariko Shiozawa, Yoshio Inoue, Minoru Sakurai
    Molecular dynamics simulation of the M intermediate of photoactive yellow protein in the crystalline state
    Chemical Physics Letters, Volume 414, Issues 1-3, 3 October 2005, Pages 230-233
  • T. Kurobori, K.Inabe, S. Aoshima, T. Itoh, M. Takeuchi and E. Radzhabov
    Time-resolved study and molecular dynamics simulation of defect centers in BaFX(X=Cl, Br) crystals
    Journal of Luminescence 87-89(2000)558-560
  • T. Kurobori, M. Liu, H. Tsunekawa, Y. Hirose and M. Takeuchi
    Molecular Dynamics Simulation of the Pressure-Induced Phase Transition In BaFCl
    Radiation Effects & Defects in Solids, 2002, Vol. 157, pp. 799-803
  • T. Kurobori, S. Kozake, T. Kawamoto and Y. Hirose
    Thermal Properties of BaFCl Crystals Simulated by Molecular Dynamics
    Jpn. J. Appl. Phys. Vol. 39(2000) pp. L537-L540, Part2, No. 6A(1 June 2000)
  • Takeo Oku, Masaki Kuno, Hidehiko Kitahara, Ichihito Narita
    Formation, atomic structures and properties of boron nitride and carbon nanocage fullerene materials
    International Journal of Inorganic Materials, Volume 3, Issue 7, November 2001, Pages 597-612
  • W. C. Lie, A. S. Acosta, H. Fujioka, T. Mano, T. Mitsui, M. Takeuchi, M. Oshima
    Theoretical study of embedded InAs quantum dots in GaAs
    Journal of Crystal Growth, Volume 229, Issues 1-4, July 2001, Pages 615-618
  • W.H. Qi, B.Y. Huang, M.P. Wang, F.X. Liu, Z.M. Yin
    Freezing of silver cluster and nanowire: A comparison study by molecular dynamics simulation
    Computational Materials Science, Volume 42, Issue 3, May 2008, Pages 517-524
  • Xue-jun ZHENG, Bo YANG, Zhe ZHU, Bo WU, Yu-liang MAO
    Kinetic Monte Carlo simulation of growth of BaTiO3 thin film via pulsed laser deposition
    Transactions of Nonferrous Metals Society of China, Volume 17, Issue 6, December 2007, Pages 1441-1446
  • Y. Kameda, M. Imano, M. Takeuchi, S. Suzuki, T. Usuki, O. Uemura
    Neutron diffraction and MD studies of LiBr hydrated melts
    Journal of Non-Crystalline Solids, Volumes 293-295, November 2001, Pages 600-606
  • Yoshikazu Suzuki, Tatsuki Ohji
    Anisotropic thermal expansion of calcium dialuminate (CaAl4O7) simulated by molecular dynamics
    Ceramics International, Volume 30, Issue 1, 2004, Pages 57-61
  • Yunmin Yang, Hiroaki Abe, Naoto Sekimura
    Behavior of Frank-loops under stress environment
    Physics Letters A, Volume 315, Issues 3-4, 25 August 2003, Pages 293-300
  • Yutaka Maniwa, Kazuyuki Matsuda, Haruka Kyakuno, Syunsuke Ogasawara, Toshihide Hibi, Hiroaki Kadowaki, Shinzo Suzuki, Yohji Achiba and Hiromichi Kataura
    Water-filled single-wall carbon nanotubes as molecular nanovalves
    Nature Materials, Volume 6, Issue 2, February 2007, Pages 135-141
  • Zhi-qiang Li, K. Ohno, Y. Kawazoe, M. Mikami, Y. Masuda
    Energetics and structures of small benzene clusters Z.-q. Li et al./Computational Materials Science 4(1995)241-248
    The list includes publications from SCIGRESS and its predecessors CAChe and Materials Explorer.

お知らせ

  • 2023年12月25日
    • SCIGRESS V3.7をリリースしました。

      <V3.7の機能追加・改良について>
      • LAMMPS機械学習力場 DeepPotentialの対応
      • LAMMPSインストール方法(WSL, Docker)の追加とGPU対応
      • LAMMPSポテンシャル割当の改良
      • LAMMPS Minimize計算の改良
  • 2023年07月25日
    • SCIGRESS V3.6をリリースしました。

      <V3.6の機能追加・改良について>
      • サーバ計算機能の強化(FujitsuクラウドサービスHPC対応)
      • 3D描画機能の向上
      • 3Dビュー視点の数値指定
      • MD二次解析「密度分布」の改良
      • Quantum ESPRESSOインストール方法(WSL)の追加
  • 2022年12月23日
    • SCIGRESS V3.5をリリースしました。

      <V3.5の機能追加・改良について>
      • Windows11正式対応
      • QuantumESPRESSO Car-Parrinello MD対応
      • QuantumESPRESSO 計算設定画面の改良
      • セル作成機能の改良
      • スプレッドシートの分子閲覧機能の改良
  • 2022年6月23日
    • SCIGRESS V3.4をリリースしました。

      <V3.4の機能追加・改良について>
      • GAMESSのNMR計算対応
      • MDスプレッドシートの複数サンプル読み込み対応
      • MD-ME計算ステータス画面の改良
      • MD-ME計算結果の任意の選択分子のみのmapファイルの作成・解析
      • MD計算結果のエリアカット表示機能
      • スプレッドシートのプロシージャの改良
      • QSAR(QSPR)記述子の生データのcsv出力
  • 2022年1月27日
    • SCIGRESS V3.3をリリースしました。

      <V3.3の機能追加・改良について>
      • LAMMPSにおけるUFF for MOF(Metal-Organic Framework)の対応
      • GAMESSの基底関数追加
      • QuantumESPRESSOの屈折率計算
  • 2021年7月14日
    • SCIGRESS V3.2をリリースしました。

      <V3.2の機能追加・改良について>
      • MDスプレッドシート
      • MD二次解析 密度分布(density distribution)解析機能
      • セル情報付きMol2ファイルのインポート/エクスポート対応

計算化学統合プラットフォーム SCIGRESSに関するお問い合わせ

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