Systemwalker Operation Managerのサービスを停止するにあたり、実行中のジョブがあればジョブの終了後にサービスを停止することはできますか？

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Systemwalker Operation Managerのサービスを停止するにあたり、実行中のジョブがあればジョブの終了後にサービスを停止することはできますか？

できます。
終了処理ジョブネットを利用してください。詳細は以下のマニュアルをご参照ください。
なお、マニュアルの内容は、システムのシャットダウンについて記述されていますが、シャットダウンをサービスの停止と読み替えて参照してください。

　Systemwalker Operation Manager V17.0.0 運用ガイド
　　付録B 留意事項
　　　B.6 ジョブスケジューラを使いこなすために
　　　　B.6.1 任意の時刻にシステムをシャットダウンする【Windows版】

　Systemwalker Operation Manager V17.0.0 リファレンス集
　　第3章カレンダ/電源制御コマンド
　　　3.1 f3crheet 待ち合わせ終了通知コマンド
　　第19章出口情報
　　　19.6 正常終了/異常終了シャットダウン出口【Windows版】

なお、上記以外の製品バージョン／レベルについては、該当するマニュアル箇所を参照してください。