サーバを再起動する場合、Systemwalker Operation Managerのサービスは事前に停止させる必要がありますか？

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サーバを再起動する場合、Systemwalker Operation Managerのサービスは事前に停止させる必要がありますか？

必要ありません。
再起動時（シャットダウン時）には、OSのService Control Managerによってサービスの停止が行われます。