Systemwalker Operation Managerで、実行継続モードの設定の有無によって、ローカルジョブの実行結果に違いは発生しますか？

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実行継続モードの設定の有無によって、ローカルジョブの実行結果に違いは発生しますか？

違いは発生しません。
ローカルジョブについては、実行継続モードの設定の有無に関わらず、サーバダウン時に実行中だった場合、終了コード239で異常終了になります。