Trend Micro ServerProtect for Linuxをアップグレードした時、Systemwalker Operation Managerに影響はありますか？

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Trend Micro ServerProtect for Linuxをアップグレードした時、Systemwalker Operation Managerに影響はありますか？

ありません。
Systemwalker Operation ManagerはServerProtectと連携する機能はありません。したがって、技術的には問題が発生することはありません。