他のジョブネットですでに発生しているメッセージ事象をSystemwalker Operation Managerクライアント側で、削除する方法はありますか？

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他のジョブネットですでに発生しているメッセージ事象をSystemwalker Operation Managerクライアント側で、削除する方法はありますか？

ありません。
クライアント側で、発生済みのメッセージ事象を削除することはできません。サーバ上でjobschmsgclearコマンドを実行して削除してください。