Systemwalker Operation Managerで、サーバ環境の移行をします。ユーザー環境（アクセス権）だけ移行することはできますか？

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サーバ環境の移行をします。ユーザー環境（アクセス権）だけ移行することはできますか？

できます。
mkbatコマンドを使用することで、移行先サーバに、移行元サーバの設定を移行することができます。
mkbatは、すでにプロジェクトに設定されているアクセス制御情報からアクセス権設定コマンド（mpsetacl）、および所有者設定コマンド（mpchown）のコマンド列を作成します。出力内容をバッチファイル／シェルスクリプトなどで作成して実行することで、移行元と同じアクセス権情報を設定できます。