サーバ再起動時（Systemwalker Operation Managerのサービス再起動時）にジョブネット停止状態は保持されていますか？

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サーバ再起動時（Systemwalker Operation Managerのサービス再起動時）にジョブネット停止状態は保持されていますか？

保持されます。
ジョブネットが停止状態でサーバを再起動しても、停止状態のジョブネットは停止状態のままです。異常終了にはなりません。