Systemwalker Centric Manager V13.1.0以降において、毎回、保守対象のノードが変わるため、監視抑止設定ファイルに複数のノードを記述しておき、その都度抑止対象外のノードの行の頭に#や;をつけて無効行とすることができますか？

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Systemwalker Centric Manager V13.1.0以降において、毎回、保守対象のノードが変わるため、監視抑止設定ファイルに複数のノードを記述しておき、その都度抑止対象外のノードの行の頭に#や;をつけて無効行とすることができますか？

できません。
監視抑止設定ファイルではコメントする機能がありませんので「#」や「;」をコメントとして扱うことはできません。
しかし「#」や「;」の任意の文字をIPアドレスの前に付加するとその文字も含めてIPアドレスと認識されますので、結果的には登録していないノードとして認識され、その行に対する処理はスキップされます。

「不要なノードに対する監視抑止の操作を行わない」という運用が目的の場合、「#」や「;」の任意の文字を先頭に付加する運用で問題ありません。
しかし、「#」や「;」の任意の文字を先頭に付加した場合は、その行に対する該当ノードがない旨のエラーメッセージが出力されます。

　「The node with #IPアドレス and ホスト名 is not found」

　IPアドレス：監視抑止設定ファイルで無効化した行のIPアドレス
　ホスト名：監視抑止設定ファイルで無効化した行のホスト名

また、エラーメッセージを出力しない方法はありません。