Linkexpressにおいて、コード変換できない文字があっても処理を継続することはできますか？

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コード変換できない文字があっても処理を継続することはできますか？

継続できます。
DB動作環境定義で、コード変換エラー検出後の処理を継続するかエラー終了するかを設定できます。