Linkexpress Replication optionは、複数の表について、関係付けがある場合、そのトランザクションを保証することはできますか？

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複数の表について、関係付けがある場合、そのトランザクションを保証することはできますか？

できます。
関係付けのある表をグルーピングすることで、トランザクションを保証します。なお、Oracle抽出レプリケーションではできません。