Interstage List Worksでは、社内で使用している独自認証シテステムを使用して認証できますか？

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社内で使用している独自認証シテステムを使用して認証できますか？

できます。
Interstage List Worksでは、ユーザー作成ライブラリによる認証出口のインターフェースを提供しています。ユーザー作成ライブラリを作成することにより、独自認証システムを使用できます。