Interstage Information Integrator において、行末に改行コードを含む固定長ファイルの変換はできますか？

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行末に改行コードを含む固定長ファイルの変換はできますか？

できます。
なお、"データ変換定義"の"改行コードの扱い"で、改行コードに"CRLF"または"LF"を設定します。

詳細は、以下のマニュアルを参照してください。

  Interstage Information Integrator V10.2.0 システム設計ガイド
    1.4 データ変換・編集

なお、上記以外の製品バージョンについては、該当するマニュアル箇所を参照してください。