Interstage Application Serverでは、ijsdeploymentコマンドでの配備時にEJBアプリケーション名を変更できますか？

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ijsdeploymentコマンドでEJBのjarファイルを配備する際に、EJBアプリケーション名を変更できますか？

EJBアプリケーション名の変更は配備時だけ設定可能ですが、ijsdeploymentコマンドでは指定できません。
EJBアプリケーション名を変更したい場合は、Interstage管理コンソールより配備してください。
もしijsdeploymentコマンドで実施する場合は、デフォルトのEJBアプリケーション名は配備資源に含まれるejb-jar.xmlのejb-nameタグを見ていますので、事前にタグに指定された名前を書き換えておくことでコマンドでも対応可能となります。