Interstage Application Serverにおいて、javacコマンドでコンパイルした結果のクラスファイルに差異があるのはなぜですか？

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Javaソースをjavacコマンドでコンパイルする際に、複数Javaソースをまとめてコンパイルするときと、1つずつコンパイルするときで、生成されたクラスファイルのサイズに差異があるのはなぜですか？

ソースファイルの指定方法の違いにより、javac内部でのコード表現に違いが出ることがあります。ただし、出力されるクラスファイルは、いずれの場合でも、Java Virtual Machine Specificationに準拠するものになり、Javaプログラムの実行動作には影響を与えません。