Interstage Application Serverにおいて、ダンプファイルextp_td001_TRCdump.XXが大量に作成されています。

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ダンプファイルextp_td001_TRCdump.XXが大量に作成されディスクを圧迫しています。削除しても問題ないですか？

問題ありません。
extp_td001_TRCdump.XXは異常が発生した際に使用するログであるため、削除することによるシステムへの影響はありません。