Interstage Application ServerのJava EEを使用したクライアントとEJBコンテナ間の通信において、SSL通信をサポートしているか教えてください。

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Java EEを使用したクライアントとEJBコンテナ間の通信において、SSL通信をサポートしているか教えてください。

サポートしていません。
通信の暗号化を行う場合、DMZにWebサーバを配置し、DMZよりフロント側で暗号化を実施してください。