Intersatge HTTP Serverにおいて、複数のバーチャルホストを作成し、それぞれのバーチャルホストに異なる「SMEEコマンドによる証明書/鍵管理環境」を設定できますか？

Interstage Application Serverのよくあるご質問を検索できます。

複数のバーチャルホストを作成し、それぞれのバーチャルホストに異なる「SMEEコマンドによる証明書/鍵管理環境」を設定できますか？

設定できません。
ただし、V9以降の場合、複数のWebサーバを構築し、それぞれのWebサーバに対して異なる「SMEEコマンドによる証明書/鍵管理環境」を設定できます。

「SMEEコマンドによる証明書/鍵管理環境」の設定方法は、以下のマニュアルを参照してください。

　セキュリティシステム運用ガイド V9
　　第13章 Interstage HTTP ServerでSSLを利用する方法