Interstage HTTP ServerにFastCGIのモジュールを組み込むことはできますか？

Interstage Application Serverのよくあるご質問を検索できます。

FastCGIのモジュールを組み込むことはできますか？

できません。
Interstage HTTP Serverでは、富士通製品で提供しているプラグインモジュールだけを使用できます。
FastCGIはサードパーティのプラグインモジュールに該当しており、サポートしていません。