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Big Data in der Medizin: Fujitsu PRIMEFLEX for Hadoop unterstützt das Deutsche Krebsforschungszentrum bei der Analyse von Genom-Daten

19. Februar 2016

Auf einen Blick:

  • Analyse von Petabyte von Genom-Daten mithilfe einer skalierbaren Hochleistungs-Plattform von Fujitsu für Big-Data-Anwendungen
  • Grundlage: Vorkonfigurierte und getestete Hard- und Software-Komponenten auf Basis von Industriestandards
  • Sofort einsetzbare Big-Data-Referenzarchitektur von Fujitsu mit Hadoop-Open-Source-Software von Cloudera
  • Geringer Einarbeitungsaufwand für die integrierte visuelle Big-Data-Analyselösung von Datameer

Das Deutsche Krebsforschungszentrum (DKFZ) in Heidelberg setzt für die Untersuchung des menschlichen Erbguts (Genoms) von Patienten Fujitsus Integrated System PRIMEFLEX for Hadoop ein. Die leistungsstarke und skalierbare Plattform ermöglicht die Analyse großer Datenmengen mit hoher Geschwindigkeit. Das DKFZ nutzt die Plattform dazu, um das Tumorerbgut von Patienten zu untersuchen. Obwohl das menschliche Genom aus “nur“ 3 Milliarden Basen-Paaren besteht, kommen dabei selbst bei wenigen Tausend Patienten schnell mehrere Petabyte an Daten zusammen. Dafür verantwortlich sind Oversampling-Faktoren und die Tatsache, dass pro Patient mehrere Gewebeproben untersucht werden können.

Normalerweise werden diese Daten mit speziellen Verfahren analysiert, um schrittweise die relevanten Informationen aufzuspüren. Kommen dabei die in der Forschung gebräuchlichen Rechner-Cluster zum Einsatz, kann es mehrere Monate dauern, bis Resultate vorliegen und die nächsten Forschungsfragen formuliert werden können. Daher lohnt es sich, die Rohdaten für eine schnelle, parallele Bearbeitung aufzubereiten. Das erfolgt beim DKFZ mithilfe der Hochleistungs-Big-Data-Infrastruktur von Fujitsu. Integrated System PRIMEFLEX for Hadoop kombiniert die Vorteile vorkonfigurierter und vorab getesteter Hardware, die auf Industrie-Standard-Komponenten basiert, mit Open-Source-Software von Cloudera® und der Big-Data-Analysesoftware von Datameer®. Anwendern wie dem DKFZ steht somit eine leistungsstarke, schlüsselfertige Big-Data-Plattform zur Verfügung, die sofort einsatzfähig ist und sich nach Bedarf erweitern lässt.

Vortrag auf dem Bitkom Big Data Summit
Auf dem Big Data Summit des Digitalverbandes Bitkom am 25. Februar 2016 im Congress Park in Hanau halten Dr. Matthias Schlesner vom DKFZ und Dr. Fritz Schinkel von Fujitsu einen Vortrag zum Thema "Schnelle Orientierung in Genomdaten" (Donnerstag, 25.02.2016 von 12:30 bis 13:00 Uhr). Dabei gehen sie auf die Vorteile ein, welche die Analyse von Rohdaten mithilfe von Big-Data-Infrastrukturen und entsprechender Analysesoftware bieten.

Mehr Informationen erhalten Sie hier:
http://www.bitkom-bigdata.de/programm/2016-02-25/schnelle-orientierung-genomdaten/

Zitate
Dr. Matthias Schlesner, Head of Computational Oncology am Deutschen Krebsforschungszentrum
„Die Analyse großskaliger biomedizinischer Datensätze in der Krebsforschung und bei der Untersuchung genetischer Erkrankungen setzt voraus, dass Rohdaten besser für eine schnelle und parallele Verarbeitung organisiert werden. Das lässt sich mithilfe von Big-Data-Infrastrukturen und einer entsprechenden Analysesoftware bewerkstelligen. Dadurch erhalten unsere Forscher deutlich schneller Antworten auf ihre Fragen. Das wiederum kommt den Patienten zugute.“

Dr. Fritz Schinkel, Head of Competence Center Big Data bei Fujitsu
„Nicht nur Unternehmen, sondern auch Forschungseinrichtungen wie das Deutsche Krebsforschungszentrum profitieren von Big-Data-Technologien. Doch dazu benötigen sie eine Hochleistungsplattform, die sich auf einfache Weise implementieren und bei Bedarf schnell erweitern lässt. Mit Integrated System PRIMEFLEX for Hadoop steht eine Lösung zur Verfügung, die exakt diese Anforderungen erfüllt. Damit leistet Fujitsu einen maßgeblich Beitrag zu einer 'Human Centric Intelligent Society'.“

Weitere Informationen zum Fujitsu Integrated System PRIMEFLEX für Hadoop erhalten Sie über

Weitere Informationen über Fujitsu erhalten Sie über

Über Fujitsu

Fujitsu ist der führende japanische Anbieter von Informations- und Telekommunikations-basierten (ITK) Geschäftslösungen und bietet eine breite Palette an Technologieprodukten, -lösungen und -Dienstleistungen. Mit rund 155.000 Mitarbeitern betreut das Unternehmen Kunden in mehr als 100 Ländern. Fujitsu nutzt seine ITK-Expertise, um die Zukunft der Gesellschaft gemeinsam mit seinen Kunden zu gestalten. Im Geschäftsjahr 2016 (zum 31. März 2017) erzielte Fujitsu Limited (TSE:6702) mit Hauptsitz in Tokio, Japan, einen konsolidierten Jahresumsatz von 4,5 Billionen Yen (40 Milliarden US-Dollar).

Über Fujitsu Central Europe (CE)

Fujitsu Central Europe (Deutschland, Österreich und die Schweiz) ist ein führender europäischer Informations- und Telekommunikations-Komplettanbieter. Das Unternehmen bietet ein umfassendes Portfolio von Technologieprodukten, Lösungen und Dienstleistungen, das von Endgeräten über Rechenzentrumslösungen, Managed und Maintenance Services und Cloud-Lösungen bis hin zum Outsourcing reicht. In der Region Central Europe erzielte Fujitsu im Geschäftsjahr 2015 (zum 31. März 2016) mit rund 2.800 Mitarbeitern einen Umsatz von mehr als 1,8 Milliarden Euro.
Fujitsu entwickelt und fertigt in Deutschland IT-Lösungen und betreibt hochsichere Rechenzentren. Mit über 10.000 Channel-Partnern in Deutschland, Österreich und der Schweiz verfügt Fujitsu zudem über eines der leistungsfähigsten Partnernetzwerke der Branche.http://www.fujitsu.com/de/

Über Fujitsu EMEIA

Fujitsu ermöglicht Kunden, größtmöglichen Nutzen aus dem Einsatz herkömmlicher, eher beständiger IT-Systeme („Robust IT) und agiler, innovativer digitalen Lösungen („Fast IT) zu ziehen. Der führende Anbieter von Informations- und Telekommunikations-basierten (ITK) Geschäftslösungen gewährleistet dies durch sein breites Portfolio an Technologieprodukten, Lösungen und Dienstleistungen, das von Arbeitsplatzsystemen über Rechenzentrumslösungen und Managed Services bis hin zu Software und Lösungen aus der Cloud reicht. Die Fujitsu Vision „Human Centric Intelligent Society“, zielt auf eine intelligente Gesellschaft, die den Menschen in den Mittelpunkt jeglicher Informations- und Kommunikationstechnologie stellt. Fujitsu EMEIA ist Teil der globalen Fujitsu Gruppe und beschäftigt in dieser Region (Europa, Naher Osten, Indien, Afrika) mehr als 29.000 Mitarbeiter. Weitere Informationen erhalten Sie unter: http://www.fujitsu.com/fts/about/

Michael Erhard

Telefon: Telefon: +49 (0)89 62060-1316
E-Mail: E-Mail: michael.erhard@ts.fujitsu.com
Unternehmen: Fujitsu Central Europe

Enno Hennrichs

Telefon: Telefon: + 49 (0) 89 23031-627
E-Mail: E-Mail: Fujitsu-PR@fleishmaneurope.com
Unternehmen: FleishmanHillard Germany GmbH

Datum: 19. Februar 2016